植物园位于厦门市区中山公园东南方，狮山、五老峰北面。它建于1960年，是围绕万石岩水库精心设计的园林，园内有规模地引种非洲、美洲、澳洲和东南亚各国的热带、亚热带植物5000多种，其中有被人称为“活化石”的水杉、银杏，世界四大观赏树——中国金钱松、日本金松、南洋杉和意大利柱柏，有难以数计的名贵仙人掌，是一座秀丽多姿、四季飘香的游览园林。
主要园区有：松杉园、竹径、蔷薇园、新碑林、小桃源、棕榈岛、百花厅、南洋杉草坪、引种驯化区、仙人掌区、玫瑰园、龙眼荔枝园、药用植物区、兰花圃等29个专类植物区，且园内有水，并饰以楼、台、亭、阁及现代化娱乐设施。
